Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3AQ05086 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms