Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EMX1Q04741 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX1Q04741 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms