Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms