Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 YLR419WYLR419W 4308 nt1.13□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 GPX1YKL026C 504 nt1.13□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 RPF2YKR081C 1035 nt1.13□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 TRX1YLR043C 312 nt1.13□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 RPS16AYMR143W 432 nt1.13□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 CMC2YBL059C-A 330 nt1.13□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 SXM1YDR395W 2835 nt1.13□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 SSK2YNR031C 4740 nt1.13□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 MMS22YLR320W 4365 nt1.12□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 SPC29YPL124W 762 nt1.12□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 SEY1YOR165W 2331 nt1.12□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 FYV8YGR196C 2454 nt1.12□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 CTF4YPR135W 2784 nt1.12□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 SPO22YIL073C 2928 nt1.12□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 SEC63YOR254C 1992 nt1.11□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 RMD6YEL072W 696 nt1.11□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 THG1YGR024C 714 nt1.11□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 SMD1YGR074W 441 nt1.11□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 YGR242WYGR242W 309 nt1.11□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt1.11□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 YJR023CYJR023C 402 nt1.11□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt1.11□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 TAP42YMR028W 1101 nt1.11□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 YPL039WYPL039W 951 nt1.11□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 PLC1YPL268W 2610 nt1.11□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 YLR422WYLR422W 5799 nt1.11□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 HIR3YJR140C 4947 nt1.1□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 MDM20YOL076W 2391 nt1.1□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 YDR042CYDR042C 603 nt1.1□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 OST5YGL226C-A 261 nt1.1□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 RPS30AYLR287C-A 192 nt1.1□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 CRM1YGR218W 3255 nt1.09□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 SEC28YIL076W 891 nt1.09□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 RPI1YIL119C 1224 nt1.09□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt1.09□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 HSK3YKL138C-A 210 nt1.09□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 YLR140WYLR140W 327 nt1.09□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 PAI3YMR174C 207 nt1.09□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 CYB5YNL111C 363 nt1.09□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 YOR169CYOR169C 465 nt1.09□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 YPL034WYPL034W 498 nt1.09□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 MGR1YCL044C 1254 nt1.09□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 LAA1YJL207C 6045 nt1.09□□□□□ -2.23
YHP1Q04116 NDD1YOR372C 1665 nt1.09□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 AHC1YOR023C 1701 nt1.09□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 KAR9YPL269W 1935 nt1.09□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 SPT14YPL175W 1359 nt1.08□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 NTF2YER009W 378 nt1.08□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 FAR7YFR008W 666 nt1.08□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 YIP1YGR172C 747 nt1.08□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 RPL40AYIL148W 387 nt1.08□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 LCL2YLR104W 396 nt1.08□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 ATP18YML081C-A 180 nt1.08□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 YBR287WYBR287W 1284 nt1.08□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 ASM4YDL088C 1587 nt1.08□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 SKI3YPR189W 4299 nt1.08□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 SPC98YNL126W 2541 nt1.08□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 YDL041WYDL041W 354 nt1.07□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 TSA2YDR453C 591 nt1.07□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 YLR458WYLR458W 381 nt1.07□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 MGE1YOR232W 687 nt1.07□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 SFG1YOR315W 1041 nt1.07□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 TFB6YOR352W 1032 nt1.07□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt1.07□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt1.07□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 PHR1YOR386W 1698 nt1.07□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 YET1YKL065C 621 nt1.06□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 PMD1YER132C 5262 nt1.06□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 snR83snR83 306 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 IST3YIR005W 447 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 BUD19YJL188C 309 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 MCM22YJR135C 720 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 YAL064WYAL064W 285 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 YLR031WYLR031W 561 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 GRX8YLR364W 330 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 ERG29YMR134W 714 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 YNL179CYNL179C 438 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 RPL33BYOR234C 324 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 YSW1YBR148W 1830 nt1.05□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 HMI1YOL095C 2121 nt1.04□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 GIC1YHR061C 945 nt1.04□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.04□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 YIL082WYIL082W 873 nt1.04□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 YAR068WYAR068W 486 nt1.04□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 RIO2YNL207W 1278 nt1.04□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 FRK1YPL141C 2598 nt1.04□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 SEC21YNL287W 2808 nt1.04□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 APM3YBR288C 1452 nt1.04□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 CTR9YOL145C 3234 nt1.04□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 BST1YFL025C 3090 nt1.03□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 IRE1YHR079C 3348 nt1.03□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 PBY1YBR094W 2262 nt1.03□□□□□ -2.24
YHP1Q04116 SRB7YDR308C 423 nt1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 103.8 ms