Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERCC6Q03468 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6Q03468 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms