Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2BQ02880 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms