Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms