Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BDH1Q02338 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BDH1Q02338 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms