Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms