Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms