Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTBN1Q01082 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms