Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSG4Q00888 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms