Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYBPC1Q00872 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYBPC1Q00872 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms