Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX1P83916 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX1P83916 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX1P83916 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX1P83916 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX1P83916 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX1P83916 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX1P83916 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX1P83916 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX1P83916 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX1P83916 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX1P83916 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX1P83916 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX1P83916 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX1P83916 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX1P83916 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX1P83916 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX1P83916 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX1P83916 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX1P83916 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX1P83916 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX1P83916 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX1P83916 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX1P83916 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX1P83916 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBX1P83916 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms