Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMF1P82094 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMF1P82094 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMF1P82094 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMF1P82094 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMF1P82094 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMF1P82094 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMF1P82094 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMF1P82094 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMF1P82094 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMF1P82094 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMF1P82094 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMF1P82094 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMF1P82094 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMF1P82094 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMF1P82094 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMF1P82094 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMF1P82094 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMF1P82094 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMF1P82094 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMF1P82094 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMF1P82094 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMF1P82094 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMF1P82094 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMF1P82094 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TMF1P82094 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMF1P82094 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMF1P82094 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMF1P82094 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMF1P82094 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMF1P82094 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMF1P82094 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMF1P82094 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMF1P82094 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMF1P82094 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMF1P82094 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMF1P82094 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMF1P82094 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMF1P82094 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMF1P82094 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMF1P82094 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TMF1P82094 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMF1P82094 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMF1P82094 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMF1P82094 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMF1P82094 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMF1P82094 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMF1P82094 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMF1P82094 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMF1P82094 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMF1P82094 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMF1P82094 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMF1P82094 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMF1P82094 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMF1P82094 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMF1P82094 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMF1P82094 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TMF1P82094 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMF1P82094 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMF1P82094 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMF1P82094 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMF1P82094 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMF1P82094 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMF1P82094 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMF1P82094 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMF1P82094 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMF1P82094 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMF1P82094 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMF1P82094 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMF1P82094 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMF1P82094 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMF1P82094 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMF1P82094 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMF1P82094 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMF1P82094 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMF1P82094 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMF1P82094 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms