Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms