Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM4P67936 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM4P67936 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM4P67936 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM4P67936 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM4P67936 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM4P67936 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM4P67936 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM4P67936 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM4P67936 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM4P67936 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM4P67936 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM4P67936 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM4P67936 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM4P67936 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM4P67936 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM4P67936 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM4P67936 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM4P67936 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM4P67936 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM4P67936 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM4P67936 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM4P67936 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM4P67936 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM4P67936 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM4P67936 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM4P67936 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM4P67936 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM4P67936 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM4P67936 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM4P67936 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM4P67936 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM4P67936 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM4P67936 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms