Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P63121 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms