Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VBP1P61758 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VBP1P61758 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VBP1P61758 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VBP1P61758 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VBP1P61758 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VBP1P61758 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VBP1P61758 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VBP1P61758 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VBP1P61758 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VBP1P61758 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VBP1P61758 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
VBP1P61758 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VBP1P61758 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VBP1P61758 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VBP1P61758 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VBP1P61758 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VBP1P61758 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VBP1P61758 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VBP1P61758 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VBP1P61758 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VBP1P61758 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VBP1P61758 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VBP1P61758 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VBP1P61758 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VBP1P61758 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VBP1P61758 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VBP1P61758 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VBP1P61758 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VBP1P61758 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VBP1P61758 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VBP1P61758 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VBP1P61758 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VBP1P61758 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VBP1P61758 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms