Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2FP61218 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms