Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTBP60709 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTBP60709 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTBP60709 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTBP60709 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTBP60709 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTBP60709 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTBP60709 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTBP60709 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTBP60709 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTBP60709 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTBP60709 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTBP60709 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTBP60709 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTBP60709 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTBP60709 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTBP60709 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTBP60709 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTBP60709 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTBP60709 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTBP60709 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTBP60709 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms