Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms