Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms