Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAX9P55771 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX9P55771 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX9P55771 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX9P55771 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms