Protein–RNA interactions for Protein: P55075

FGF8, Fibroblast growth factor 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF8P55075 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGF8P55075 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGF8P55075 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGF8P55075 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGF8P55075 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FGF8P55075 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGF8P55075 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGF8P55075 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms