Protein–RNA interactions for Protein: P53672

CRYBA2, Beta-crystallin A2, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA2P53672 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CRYBA2P53672 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRYBA2P53672 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms