Protein–RNA interactions for Protein: P52815

MRPL12, 39S ribosomal protein L12, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL12P52815 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPL12P52815 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms