Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFNA3P52797 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms