Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK2P49760 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK2P49760 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK2P49760 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK2P49760 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK2P49760 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK2P49760 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK2P49760 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK2P49760 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK2P49760 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK2P49760 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK2P49760 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK2P49760 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK2P49760 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK2P49760 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK2P49760 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK2P49760 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK2P49760 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK2P49760 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK2P49760 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK2P49760 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK2P49760 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK2P49760 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK2P49760 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK2P49760 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK2P49760 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK2P49760 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK2P49760 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK2P49760 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK2P49760 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK2P49760 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK2P49760 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK2P49760 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK2P49760 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK2P49760 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK2P49760 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK2P49760 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK2P49760 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK2P49760 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK2P49760 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK2P49760 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK2P49760 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK2P49760 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK2P49760 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK2P49760 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK2P49760 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK2P49760 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK2P49760 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK2P49760 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK2P49760 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK2P49760 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK2P49760 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK2P49760 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK2P49760 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK2P49760 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK2P49760 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK2P49760 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK2P49760 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK2P49760 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK2P49760 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK2P49760 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK2P49760 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK2P49760 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK2P49760 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK2P49760 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK2P49760 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK2P49760 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK2P49760 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK2P49760 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK2P49760 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK2P49760 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK2P49760 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK2P49760 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK2P49760 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK2P49760 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms