Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLK1P49759 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLK1P49759 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLK1P49759 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLK1P49759 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLK1P49759 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLK1P49759 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLK1P49759 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLK1P49759 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLK1P49759 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLK1P49759 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLK1P49759 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLK1P49759 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLK1P49759 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLK1P49759 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLK1P49759 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLK1P49759 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLK1P49759 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLK1P49759 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLK1P49759 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLK1P49759 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms