Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNPDA1P46926 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms