Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RANGAP1P46060 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
RANGAP1P46060 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RANGAP1P46060 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms