Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTTP42858 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTTP42858 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
HTTP42858 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
HTTP42858 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTTP42858 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTTP42858 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTTP42858 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTTP42858 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTTP42858 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTTP42858 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HTTP42858 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTTP42858 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTTP42858 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HTTP42858 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTTP42858 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTTP42858 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTTP42858 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTTP42858 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTTP42858 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTTP42858 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTTP42858 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTTP42858 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTTP42858 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTTP42858 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTTP42858 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTTP42858 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTTP42858 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTTP42858 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTTP42858 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HTTP42858 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTTP42858 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTTP42858 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTTP42858 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTTP42858 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTTP42858 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTTP42858 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTTP42858 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTTP42858 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTTP42858 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTTP42858 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTTP42858 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTTP42858 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTTP42858 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTTP42858 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTTP42858 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTTP42858 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTTP42858 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTTP42858 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HTTP42858 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTTP42858 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTTP42858 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTTP42858 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTTP42858 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTTP42858 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTTP42858 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTTP42858 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HTTP42858 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTTP42858 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTTP42858 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTTP42858 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTTP42858 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTTP42858 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTTP42858 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTTP42858 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTTP42858 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTTP42858 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTTP42858 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms