Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACAA2P42765 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms