Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP2P42575 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP2P42575 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP2P42575 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP2P42575 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP2P42575 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP2P42575 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP2P42575 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP2P42575 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP2P42575 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP2P42575 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP2P42575 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP2P42575 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP2P42575 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP2P42575 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP2P42575 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP2P42575 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP2P42575 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP2P42575 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP2P42575 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms