Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPARGP37231 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPARGP37231 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPARGP37231 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPARGP37231 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPARGP37231 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPARGP37231 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPARGP37231 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPARGP37231 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPARGP37231 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPARGP37231 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPARGP37231 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPARGP37231 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPARGP37231 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPARGP37231 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPARGP37231 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPARGP37231 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms