Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP62P37198 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP62P37198 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP62P37198 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP62P37198 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP62P37198 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP62P37198 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP62P37198 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP62P37198 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP62P37198 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP62P37198 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP62P37198 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP62P37198 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP62P37198 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP62P37198 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP62P37198 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP62P37198 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP62P37198 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms