Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN7P35236 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms