Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP1P32455 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP1P32455 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP1P32455 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP1P32455 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP1P32455 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP1P32455 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP1P32455 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP1P32455 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP1P32455 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP1P32455 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP1P32455 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP1P32455 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP1P32455 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP1P32455 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP1P32455 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP1P32455 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP1P32455 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP1P32455 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms