Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms