Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPS1P31327 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPS1P31327 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPS1P31327 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPS1P31327 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPS1P31327 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPS1P31327 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPS1P31327 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPS1P31327 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPS1P31327 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPS1P31327 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPS1P31327 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPS1P31327 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPS1P31327 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPS1P31327 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CPS1P31327 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CPS1P31327 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CPS1P31327 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CPS1P31327 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CPS1P31327 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CPS1P31327 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CPS1P31327 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CPS1P31327 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPS1P31327 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CPS1P31327 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPS1P31327 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPS1P31327 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPS1P31327 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPS1P31327 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPS1P31327 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPS1P31327 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPS1P31327 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPS1P31327 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPS1P31327 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPS1P31327 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPS1P31327 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPS1P31327 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPS1P31327 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPS1P31327 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPS1P31327 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPS1P31327 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPS1P31327 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPS1P31327 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPS1P31327 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPS1P31327 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPS1P31327 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPS1P31327 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPS1P31327 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CPS1P31327 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPS1P31327 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPS1P31327 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPS1P31327 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPS1P31327 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPS1P31327 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPS1P31327 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPS1P31327 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPS1P31327 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPS1P31327 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPS1P31327 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPS1P31327 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CPS1P31327 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPS1P31327 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPS1P31327 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPS1P31327 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPS1P31327 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPS1P31327 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPS1P31327 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CPS1P31327 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPS1P31327 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPS1P31327 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPS1P31327 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPS1P31327 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPS1P31327 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPS1P31327 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPS1P31327 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPS1P31327 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPS1P31327 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPS1P31327 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPS1P31327 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPS1P31327 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CPS1P31327 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPS1P31327 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPS1P31327 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms