Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms