Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA10P31260 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms