Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLD1P28340 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLD1P28340 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLD1P28340 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLD1P28340 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLD1P28340 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLD1P28340 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLD1P28340 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLD1P28340 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLD1P28340 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLD1P28340 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLD1P28340 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLD1P28340 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POLD1P28340 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLD1P28340 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLD1P28340 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLD1P28340 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLD1P28340 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLD1P28340 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLD1P28340 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLD1P28340 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLD1P28340 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLD1P28340 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLD1P28340 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLD1P28340 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLD1P28340 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLD1P28340 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLD1P28340 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLD1P28340 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLD1P28340 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLD1P28340 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLD1P28340 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLD1P28340 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLD1P28340 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLD1P28340 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLD1P28340 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLD1P28340 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLD1P28340 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLD1P28340 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLD1P28340 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLD1P28340 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLD1P28340 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLD1P28340 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLD1P28340 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLD1P28340 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
POLD1P28340 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLD1P28340 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLD1P28340 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLD1P28340 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLD1P28340 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLD1P28340 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLD1P28340 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLD1P28340 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLD1P28340 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLD1P28340 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLD1P28340 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLD1P28340 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLD1P28340 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLD1P28340 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLD1P28340 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLD1P28340 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLD1P28340 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLD1P28340 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLD1P28340 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLD1P28340 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLD1P28340 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLD1P28340 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLD1P28340 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
POLD1P28340 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLD1P28340 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLD1P28340 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLD1P28340 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLD1P28340 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLD1P28340 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLD1P28340 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLD1P28340 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLD1P28340 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLD1P28340 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLD1P28340 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLD1P28340 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLD1P28340 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLD1P28340 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms