Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA2P26232 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms