Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms