Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms