Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSHP23434 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSHP23434 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSHP23434 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSHP23434 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSHP23434 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSHP23434 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSHP23434 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSHP23434 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSHP23434 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSHP23434 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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