Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms