Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDK11BP21127 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms